El doctorado conjunto es un programa de doctorado organizado por dos o más universidades que conduce a la obtención de un único título.

El doctorado en cotutela consiste en la elaboración de una tesis doctoral dirigida por dos directores o directoras (de la UPV/EHU y de la universidad extranjera) en dos programas de doctorado (uno de cada universidad) que conduce a la obtención de dos títulos (uno por cada universidad).