El Departamento de Inmunología, Microbiología y Parasitología se compone de 3 Secciones Departamentales, denominadas Sección Departamental de la Facultad de Ciencia y Tecnología (Leioa), Sección Departamental de la Facultad de Farmacia (Vitoria-Gasteiz) y Sección Departamental de la Facultad de Medicina y Odontología (ahora Facultad de Medicina y Enfermería) (Leioa).

Las áreas de conocimiento que conforman este departamento son la Inmunología, la Microbiología y la Parasitología.

Este Departamento imparte docencia en varios grados y también tiene una larga experiencia en docencia de postgrado. Actualmente es responsable del Máster Microbiología y Salud y del Programa de Doctorado en Inmunología, Microbiología y Parasitología.

En el Departamento están constituidos varios grupos de investigación cuyo trabajo se desarrolla en líneas relacionadas con las infecciones humanas, y también otras de ámbito medioambiental. Además algunos profesores colaboran con proyectos de investigación liderados desde otros departamentos. Asimismo, existen vinculaciones investigadoras y de formación con otros centros y Universidades.